Universidade Federal do Espírito Santo

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Informações Gerais
Disciplina:
Introdução à bioinformática ( PGGM1053 )
Unidade:
Coordenação do Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento
Tipo:
Optativa
Período Ideal no Curso:
Sem período ideal
Nota Mínima para Aprovação:
6.00
Carga Horária:
60
Número de Créditos:
4

Objetivos
Geral Compreender a bioinformática como ciência interdisciplinar, seu papel no entendimento de problemas complexos na biologia e como aplicá-la em estudos de genômica e metagenômica, com foco em ciências agrárias. Específicos 1) Revisar e consolidar conhecimento sobre dogma central da biologia molecular, com enfase nas biomoléculas e fluxo de informação; 2) Reconhecer os componentes básicos de um computador e como influenciam processamento de informação; 3) Aprender os fundamentos do sistema Unix/Linux e o uso do shell para manipulação de arquivos e execução de programas bioinformáticos; 4) Compreender conceitos de alinhamentos simples e múltiplos e desenvolver habilidade no uso do algoritmo BLAST. 5) Compreender funcionamento e diferenças de bancos de dados gerais e especializados; 6) Reconhecer as principais tecnologias de sequenciamento de DNA e suas aplicações; 7) Compreender e aplicar conhecimentos de genômica e metagenômica;

Ementa
Bases da biologia molecular; Componentes básicos de um computador; Princípios das linguagens de programação; Formatos de dados; Algoritmos de alinhamento simples e múltiplo; Banco de dados geral e especializados; Tecnologias de sequenciamento; Genômica; Metagenômica.

Bibliografia
(PT-BR) Alberts, B. et al. (Orgs.). Biologia Molecular da Célula – 6a. ed. Porto Alegre: ArtMed, 2017. (PT-BR) Lodish, H. et al. (Orgs.). Biologia Celular e Molecular. 7a. ed. Porto Alegre: ArtMed, 2014. (EN) Lesk, A.M. (2012). Introduction to Genomics. Oxford University Press, 2nd edition, USA. (EN) Lesk, A.M. (2014). Introduction to Bioinformatics. Oxford University Press, 4th edition, USA. (PT-BR) Verli, H. (2014). Bioinformática: da Biologia à Flexibilidade Moleculares. 1a edição, Porto Alegre, Brasil.

Bibliografia Complementar
Artigos publicados em revistas científicas que aplicam técnicas de bioinformática: Nature, Science, Nucleic Acid Research, Bioinformatics, BMC Bioinformatics e outras.
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