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A disciplina tem por objetivo capacitar o aluno a: Verificar a diversidade microbiológica e sua correlação com bioprocessos aplicados a Engenharia Ambiental; Reconhecer e aplicar os principais conceitos biológicos para a engenharia ambiental; Estimular a aplicação de microrganismos nos diversos processos ambientais; e Solucionar problemas práticos aplicados ao meio ambiente

Bioprocessos e Engenharia Ambiental. Biodiversidade e Taxonomia Microbiana. Grandes Grupos Microbianos: Bactérias, Arqueias, Algas, Fungos, Protozoários, Vírus. Metabolismo Microbiano. Crescimento e Controle Microbiano. Ciclos Biogeoquímicos. Biomonitoramento. Microbiologia de águas: Cianobactérias, Colimetria. Microbiologia do solo. Microbiologia do Ar. Bioprocessos aplicados a Engenharia Ambiental.

MADIGAN, M. T.; Martinko, J. M. e Parker, J. Microbiologia de Brock. 14. Edição. Ed. ArtMed Porto Alegre 2016. ISBN 978-85-8271-298-6 TORTORA, G. J. B R. Funke, C L. Case ; Microbiologia.  10. ed. – Ed. ArtMed Porto Alegre. 2012. ISBN 978-85-363-2698-6 MELO, Itamar Soares. Microbiologia ambiental / editado por Itamar Soares de Melo e Joao Lucio de Azevedo. — 2a ed. - Jaguariuna: Embrapa Meio Ambiente, 2008. 647p. ISBN 978-85-85771-44-7.

MAIER, Raina M.; PEPPER Ian L.; GERBA Charles P. Environmental Microbiology. 2ª ed. Editora: Academic Press. 2009. Azevedo, N., Cerca, F. : Biofilmes na Saúde, No Ambiente, na Indústria Editora: Publindústria 1ª Ed ISBN: 9789728953935   396pp. 2012 Madsen, E.L. Environmental Microbiology, Ed. John Wiley & Sons ISBN:9781118439630  590 pp, 2015 Souza M.F; Siqueira J.O. Microbiologia e Bioquímica do Solo. Ed. Edufla. ISBN: 858769233x  3090 pp.  2006 Shah M.P., B.R.M. Vyas (Editors). Emerging Technologies in Applied and Environmental Microbiology (Developments in Applied Microbiology and Biotechnology) 1st Edition. ISBN-10 :  032399895X  ISBN-13 :  978-0323998956, 2023. Volodymyr T.I., Environmental Microbiology For Engineers  ISBN 10:1420092340  ISBN 13: 9781420092349, CRC Press, 402 pp.,. 2010,