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A evolução da Agroecologia como ciência (processo histórico da construção teórica e cientifica); Bases cientificas da Agroecologia (Cartesiana ou não); Transição agroecológica (o desafio da teoria para prática); Eficiência energética nos Agroecossistemas; Recursos genéticos nos Agroecossistemas; Diversidade nos Agroecossistemas (Arranjos populacionais); Dinâmica da materia orgânica nos Agroecossistemas; Interações entre espécies nas comunidades. Teoria de nicho ecológico; Teoria da trofobiose.

ALTIERI, M. Agroecologia: bases científicas para uma agricultura sustentável. 2012. 3ª edição. Editora AS-PTA, 400p. ALTIERI, M. 2009. Agroecologia: a dinâmica produtiva da agricultura sustentável. 5ª Edição. Porto Alegre, Editora da UFRGS, 110p. GLIESSMAN, S. R.Agroecologia: processos ecológicos em agricultura sustentável. 2005. 3ª Edição. Porto Alegre, Editora da UFRGS, 653p. PAUL GEPTS, THOMAS R. FAMULA, ROBERT L. BETTINGER, STEPHEN B. BRUSH, ARDESHIR B. DAMANIA, PATRICK E. MCGUIRE, CALVIN O. QUALSET. Biodiversity in Agriculture: Domestication, Evolution, and Sustainability. 2012. Cambridge University Press, 562p. AQUINO, A. M. & ASSIS, R. L. Agroecologia: princípios e técnicas para uma agricultura orgânica sustentável. (Editores Técnicos) 2006. Brasília, Embrapa Informação Tecnológica, 517p. GLIESSMAN, S. R. Field and Laboratory Investigations in Agroecology. 2006. 3ª Edição. CRC Press, 450p. Periódicos científicos para obtenção de artigos científicos atualizados sobre as temáticas do conteúdo programático.