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O curso visa fornecer uma compreensão dos fundamentos teóricos e conceitos essenciaisda Dinâmica Molecular Clássica e realizar simulações computacionais (GOMACS) em diferentescondições termodinâmicas, explorando propriedades estruturais, dinâmicas e termodinâmicas.

Formalismos da Mecânica Clássica: Formalismo Newtoniano; Formalismo Lagrangiano; Formalismo Hamiltoniano;Leis da Conservação; Equações de Movimento.  Mecânica Estatística e o Cálculo das Propriedades Físicas: Mecânica Estatística Clássica; Ensamble Micro-canônicoEnsamble Canônico; Propriedades Termodinâmicas; Propriedades Estruturais; Propriedades Dinâmicas. Potenciais de Interação: Potenciais Descontínuo; Potenciais Contínuos; Outros Potenciais. Dinâmica Molecular na Prática: Modelo Físico; Condições de Contorno; Convenção de Mínima Imagem;Condições Iniciais; Medidas Observáveis; Passos de Integração; Exemplos concretos de aplicações;Simulações em sistemas de interesse.

ABC da Simulação Computacional, José Pedro Rino, Bismarck Vaz da Costa, 1 Ed., 2013, Editora: Livraria da Física; Molecular Dynamics Simulations: Fundamentals and Applications; Kun Zhou and Bo Liu, Elsevier; GROMACS Documentation, Release 2023.2,GROMACS development team, Jul 12, 2023.