Universidade Federal do Espírito Santo

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Informações Gerais
Disciplina:
Introdução à Análise de Dados de Expressão Gênica ( PGGM1041 )
Unidade:
Coordenação do Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento
Tipo:
Optativa
Período Ideal no Curso:
Sem período ideal
Nota Mínima para Aprovação:
7.00
Carga Horária:
60
Número de Créditos:
4

Objetivos

Ementa
Introdução a transcriptomica, Análise global do transcriptoma, Análise exploratória de dados de transcriptoma, ferramentas de análise exploratoria de dados, Deteção de vias de regulação no transcriptoma, bancos de dados e ferramentas para modelagem de redes de regulação, Analise de expressão diferencial gênica (DEG), ferramentas para DEG no R: edgeR e DESeq2, Clustering aplicado a dados de expressão gênica, conceitos e aplicações com dados RNAseq, Analise de co-expressao gênica, conceitos e prática, Desenvolvimento de conceitos, algoritmos e aplicação de ferramentas para análise de dados de expressão gênica.

Bibliografia
Jones, N. A. and Pevzner, P. A. (2015). An Introduction to Bioinformatics Algorithms. The MIT Press. Stark et al., 2019. \"RNA sequencing: the teenage years\". Nature Reviews Genetics. Mehmood et al., 2014. \"Use of Bioinformatics Tools in Different Spheres of Life Sciences\". J. of Data Mining in Genomics & Proteomics;A. Alberts et al., Molecular Biology of the Cell.

Bibliografia Complementar
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